به گزارش جماران؛ متن پیام آیت الله سید محمد موسوی خوئینی بدین شرح است: 

بسم الله الرحمن الرحیم 

إنا لله و إنا إلیه راجعون

شهادت حضرت آیت‌الله خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی ایران، فوزی عظیم  و پاداش عمری تلاش مجاهدانه برای تبیین مبانی دینی و معارف اسلامی بود.

گوارا باد بر او جام طهوری که از کوثر ولایت نوشید.

شهید نامدار جمهوری اسلامی از شخصیت‌های مؤثر در مبارزه با رژیم ستمشاهی و از یاران مخلص امام خمینی، رضوان‌الله‌تعالیٰ‌علیه، تا پیروزی انقلاب اسلامی و پس از آن، تا پایان عمر پربرکت بنیانگذار جمهوری اسلامی بود.

این شهید بزرگوار پس از پیروزی انقلاب مورد خشم و کینهٔ بدخواهانِ خیزش ملت بزرگ ایران قرار گرفت؛ منافقین قصد جان او را کردند، ولی تقدیر الٰهی آن نبودکه تروریست‌های منافق می خواستند، هرچند آسیب سنگینی از آن ترور بر ایشان وارد شد که رنج فراوانی را تا پایان عمر صبورانه تحمل کرد.

این شهید والامقام، با همهٔ اشتغالات توان‌سوزی که در دوران ریاست جمهوری و نیز رهبری داشت، همواره اهل تهجد و ذکر و تسبیح و تلاوت قرآن بود و اگر صاحب دلی و قدرت سیرتی را می‌شناخت سعی می‌کرد از نفس گرم و دم مسیحایی او حظی و توشه‌ای نصیب خود کند؛ خداوند او را در آن عالم از محضر اولیاء دین، اجداد طاهرینش و صدیقهٔ طاهره بهره‌مند فرماید. 

و اما کلمه‌ای هم درباره قاتلینِ «شهید ایران»؛ که دو چهرهٔ منفور نزد مستضعفان عالم هستند، یکی شهره به نسل‌کشی و کودک‌کشی است و دیگری در رسوایی مفاسد اخلاقی بر تارک رؤسای جمهور بدنام تاریخ نشسته است. ننگ بشریّت است که افرادی چنین پلشت و پلید سکان ادارهٔ کشورها را به دست گرفته‌اند؛ ننگ و نفرت و نفرین همهٔ انسان‌های شریف بر آنان باد. 

و اما وظیفهٔ ما پس از این ضایعهٔ اسفناک چیست؟ بدون تردید همهٔ ما شهروندان ایران به حکم وظیفهٔ الٰهى و ملی، از نظام قانونی مستقر باید حمایت کنیم و با مردم ناراضی از آنچه بر آنان و بر کشورشان  می‌گذرد، حتی با آنان که لبریز از خشم‌اند، دوستانه و برادرانه گفت‌وگو کنیم و به آنان حق دهیم که سنگینی مشکلات صبر و شکیبایی‌شان را گرفته باشد، بویژه با مصیبت دیدگان و داغداران حوادث دیماه تا آنجا که در توان داریم بکوشیم با گفتار و رفتارمان از سنگینی غم آنان بکاهیم، باید آنان را صبورانه با گفتگوی همدلانه به این حقیقت برسانیم که حل مشکلات امروز از مسیر خرد و توانایی خود ما ایرانیان می‌گذرد که با همهٔ وجود این مشکلات را لمس کرده و چشیده‌اند، نه به دست سردمداران رژیمی که اصل وجود و بقایش بر رودی از خون مظلومان بی‌پناه فلسطین نشسته است و نه به دست رئیس‌جمهوری که به هیچ نظم قانونی و اخلاقی و بین المللی پایبند نیست. 

سنگینی مصیبتی که به دست آدمکشان بدنام بر ملک و ملت ایران وارد شده است نباید ما را ناامید کند؛ باید با حفظ استقلال ایران سربلند و با تکیه بر آزادی همه ایرانیان در اظهار نظر و ابراز رأی دربارهٔ امور کشورشان مشکلات را به‌گونه‌ای اصولی و ریشه‌ای حل کنیم و مسیر توسعه و پیشرفت کشور را هموار سازیم.

در ساختن آیندهٔ ایران عزیز و سربلند این سخن امام را که «زمان و مکان دو عنصر تعیین‌کننده در اجتهاد است» به‌عنوان اصل طلایی راهنمای عمل قرار دهیم، اصلی که می‌تواند بسیاری از مشکلات را در شیوهٔ ادارهٔ کشور از سر راه بردارد.  

لازم است شهادت سرافرازانه رهبر عالیقدر و اعضاء خانوادهٔ محترم و فرماندهان و دیگر عزیزان به‌ویژه دختران معصوم مینابی و معلمانشان و دیگر هم‌وطنان را که در روزهای گذشته به دست بدنامان روزگار به شهادت رسیده‌اند به ملت بزرگ ایران و به تمامی بازماندگان و مصیبت‌دیدگان تسلیت عرض کنم و برای آنان در این ماه مبارک، رحمت واسعهٔ الٰهى را مسئلت نمایم.    

سید محمد موسوی خوئینی

١١اسفند ١٤٠٤