در همه سال هایی که امام خمینی (س) در عراق مجاور حرم بودند، همه آداب زیارت حضرت امیر سلام الله علیه و سید الشهدا علیه السلام را به جا می آوردند. آیت الله محمد هادی معرفت درباره این رفتار امام نقل کرده است: 

یک وقت من در کربلا در حرم امام حسین (ع) بودم که امام به حرم تشریف‌‎ ‎‌آوردند. کربلا در سال هفت زیارت مخصوصه دارد. نجف سه زیارت مخصوصه دارد.‌‎ ‎‌علاوه بر شب های جمعه، ایشان هفت زیارت را مقید بودند که به کربلا مشرف بشوند ولی‌‎ ‎‌شب های جمعه نمی رسیدند به حرم مشرف بشوند.‌

‌‌ایشان در حرم متعبد بودند، مثل سایر متعبدین، دعا و نماز بخوانند. سایر آقایان‌‎ ‎‌علما این جور نبودند، حرم آنها ده دقیقه و فوقش یک ربع ساعت طول می کشید و دعا‌‎ ‎‌را‌‎ ‎‌هم از حفظ می خواندند و دو رکعت نماز می خواندند و می رفتند؛ اما امام مثل سایر‌‎ ‎‌مردم می نشستند و از روی مفاتیح دعا و زیارت می خواندند.‌

به نقل از آیت الله محمد هادی معرفت؛ برداشت هایی از سیره امام خمینی (س)؛ ص 26