روز شنبه، در جريان برگزاري مراسم سالگرد ارتحال امام خميني(ره)، بار ديگر طبق همان سنت قديمي، عده‌اي در ميان جمعيت با اقدامي هماهنگ شعارهايي سر داده و مانع سخنراني سيد حسن خميني، نوه امام(ره) شدند. جمعيت كه وضوح شعارهاي‌شان خطاب به سيد حسن بود، فرياد مي‌زدند: «مرگ بر ضد ولايت فقيه» و «ما اهل كوفه نيستيم، علي تنها بماند» البته سيد حسن خميني در ميان اين شعارها به صحبت خود ادامه داد و واكنشي نشان نداد. اين رفتار عده‌اي در ميان جمعيت، با اعتراض رهبر معظم انقلاب نيز مواجه شد و ايشان در سخناني تصريح كردند كه اين رويه تخريب را نمي‌پسندند. ايشان اعلام كردند: «شنيدم كه امروز در اثناي سخنان جناب آقاي سيد حسن خميني، كساني سروصدا كردند، با اين كار بنده مخالفم، با اين نوع تخريب كردن‌ها و سروصدا كردن‌ها بنده موافق نيستم، من مخالفم، اين را بدانند همه، اميدوارم خداي متعال همه ما را به راه راست هدايت كند.» البته اين نخستين‌بار نيست كه در جريان سخنراني سيد حسن خميني در مراسم سالگرد ارتحال امام(ره)، اخلال ايجاد مي‌شود. يك‌بار در سال 89 و يك‌بار نيز در سال 91، همين ماجرا تكرار شد. در سال 89 بعد از سخنراني احمدي‌نژاد، موقع خوشامدگويي حجت‌الاسلام سيد حسن خميني و قبل از سخنان رهبر معظم انقلاب نيز شعارهايي مشابه سر داده شد كه باعث شد سخنراني وي چندبار با وقفه مواجه شود. سيد حسن خميني هم در مواجهه با اين شعارها گفت: «اگر دوستان بناي شعار دادن دارند، اجازه بدهند كه من چند كلمه‌اي صحبت كنم، زماني كه رهبري بزرگوار آمدند، آن وقت ابراز احساسات كنيد، شأن مراسم امام چنين نيست.» سيد حسن خميني كه نتوانست سخنراني خود را تمام كند، با گفتن اين جمله سخنراني خود را نيمه‌تمام به پايان رساند: «قطعا در حرم امام افرادي هستند كه از اين گروه اندكي كه شلوغ مي‌كنند، بيزار هستند، همان‌طور كه مي‌بينيد عده‌اي مانع سخنراني مي‌شوند، تا بوده چنين بوده، هنوز بيست سال از رحلت امام نگذشته است.» بعد از سخنراني نيمه‌تمام وي، رهبر معظم انقلاب در ابتداي ورود به جايگاه بر پيشاني نوه امام راحل بوسه زدند. البته در آن روز از انتخابات پرحاشيه رياست‌جمهوري در سال 88 يك‌سال مي‌گذشت. البته در آن زمان اين‌طور مطرح شد كه محمود احمدي‌نژاد نيز برنامه مراسم را رعايت نكرد. محمود احمدي‌نژاد به‌رغم تذكر‌هاي حميد انصاري، كاملا به عمد و به‌رغم تذكرها چنان سخنراني خود را طولاني كرد كه مجالي براي توليت حرم و يادگار امام باقي نماند. در پايان نيز او را ناديده انگاشت و از مردم خواست به سخنراني مقام معظم رهبري گوش دهند. اما چند دقيقه بعد توليت حرم پشت تريبون قرار گرفت و شروع به سخنراني كرد. در اين ميان گروهي از افرادي كه در جلوي جايگاه نشسته بودند، به ناگهان بنا كردند به شعار سر دادن و از جمله: نواده روح‌الله، سيد حسن نصرالله. يعني نوه امام خميني دبيركل حزب‌الله لبنان است نه او. اين داستان چنانكه اشاره شد مربوط به سال 1389 است اما دو سال بعد و در سال 1391 كه ميانه احمدي‌نژاد و اصولگرايان بر سر وزير اطلاعات و رييس دفتر شكرآب شده بود در سخنان خود او نيز كه آخرين بار در مقام رييس‌جمهوري حاضر مي‌شد اخلال ايجاد ‌كردند. محمدعلي انصاري، دبير ستاد بزرگداشت سالگرد امام خميني با اشاره به پشت پرده‌هاي حوادث روز چهاردهم خرداد، در نامه‌اي به عنوان «گزارش به حسن خميني» نوشت: وزير كشور در نامه‌اي به محمود احمدي‌نژاد يادداشت داد كه بيشتر سخنراني كند تا وقتي براي سخنراني حسن خميني نماند. در اين ميان محمدعلي انصاري دبير ستاد مركزي بزرگداشت امام خميني چندين بار به محمود احمدي‌نژاد اشاره كرد كه زمان او تمام شده و بايد سخنراني خود را تمام كند اما او اعتنايي نكرد و پس از آنكه سخنان خود را با اين عبارت كه «اكنون توجه شما را به سخنان مقام رهبري جلب مي‌كنم» ادا كرد، به سوي انصاري آمده و عتاب‌آميز گفت: «شما چه كاره‌ايد و به چه حقي به من يادداشت مي‌دهيد.» هر چند احمدي‌نژاد بعدها در شهريور ۱۳۹۳ در جريان بازديد از روند توسعه آرامگاه روح‌الله خميني با سيد حسن خميني ديدار داشت و اندكي بعد نيز در نامه‌اي به او مجموعه هداياي دوران رياست‌جمهوري خود را به موزه توليت آرامگاه روح‌الله خميني اهدا كرد. احمدي‌نژاد در بخشي از اين نامه‌چنين گفته : «امروز نيز همچنان در همه جاي جهان نام مبارك امام خميني گرماي حقيقت و شور زندگي و حركت آرماني را بر دل و جان و انديشه و عمل همگان مي‌تاباند و روح آزادگي را در جوامع مي‌گستراند». سيد حسن خميني نيز در بهمن ۱۳۹۳، در منزل احمدي‌نژاد حاضر شد تا درگذشت مادر وي را به او تسليت بگويد. خردادماه همان سال احمدي‌نژاد متقابلا در جماران حضور يافت و از سيد حسن خميني به سبب حضور در منزل خود و ابراز همدردي به مناسبت درگذشت مادر خويش قدرداني كرد. آيت‌الله هاشم‌زاده‌هريسي، عضو مجلس خبرگان رهبري در گفت‌وگو با ديد‌بان ايران در پاسخ به سوالي درباره برخورد صورت گرفته با سيد حسين خميني در مراسم ارتحال بنيانگذار جمهوري اسلامي گفت: «جرياني در سال‌هاي اخير «امام‌زدايي» را به صورت عملي دنبال كرده و به دنبال مصادره كردن انقلاب در جهت تفكرات و خط‌مشي سياسي خود است. برخورد اين جريان با افراد نزديك به امام خميني(ره) و هر كسي كه بر خلاف خط فكري آنها هم حرف بزند، برنامه‌ريزي شده و عامدانه است.»