حضرت آيت‌الله موسوي اردبيلي گفت: ما تفاوت فقهي با اهل سنت داريم، ولي چيزي نبايد عامل درگيري مسلمانان با هم شود و مسائلي كه امروز توسط گروه‎هاي افراطي مطرح مي‏‌شود هيچ جايگاهي ندارد و ريشه در توطئه دشمنان اسلام و مسلمانان دارد.
به گزارش خبرگزاري حوزه، اين مرجع تقليد در ديدار اعضاي جهاد دانشگاهي استان قم كه در دفتراين مرجع تقليد برگزارشد با اشاره به اهميت انطباق و هماهنگي تحقيقات علمي به‌ويژه در حوزه پزشكي و سلول‎هاي بنيادي و ناباروري با فقه و حوزه، تصريح كرد: جهاد بايد هميشه اين ارتباط را با ورود فقه‎شناسان به اين عرصه‎ها حفظ كند.
ايشان بيان داشت: جهادگران علمي كشور بايد تلاش خود را براي شناسايي ابواب جديد علم در سطوح مختلف و مشروع طي كنند و نبايد جلوي توليد و گسترش علم را گرفت، از نظر ما شبيه‎سازي در آن حد و آن صراحتي كه حرمت آن اعلام مي‎شود، نيست؛ بلكه در اين باره مباحث جدي‎تري را مي‎طلبد چون كه در برخي موارد مي‎تواند بخشي از مشكلات انساني را حل كند.
آيت‌الله موسوي اردبيلي اظهارداشت: در اين مسائل نبايد به اين صراحت اظهار نظر كرد؛ البته بايد اين مباحث در حوزه فقه به شكل جدي به‌طور كامل مطرح و بررسي شود. مسائلي را كه تحت عنوان مسائل سني و شيعه امروز در بسياري از مراكز بحث مي‎كنند، هم بيشتر مسائل و اختلافات تاريخي است كه بررسي آنها نيازمند كار علمي است و بايد ميان علما و مراكز علمي روي آنها بحث شود.