به گزارش 55 آنلاین ،  شهرت اصلی محمدی گیلانی به دلیل ماجرای اعدام دو تن از فرزندانش است؛ ماجرایی که از دو سال قبل که وضع جسمانی او رو به وخامت گذاشت، تکذیب شده است. برخی، به صراحت، ادعا کرده اند که محمدی گیلانی دو فرزند خود، که به عضویت سازمان مجاهدین خلق درآمده بودند، را شخصاً محاکمه و به اعدام محکوم کرده‌است،که این موضوع تکذیب شد.

به گفته پزشک معالج، در بیستم خرداد ۱۳۹۳، وی کاملا هوشیاری خود را از دست داده و سیستم مغزی او دچار اختلال شده است.
گیلانی پس از پیروزی انقلاب اسلامی از سوی رهبر معظم انقلاب آیت‌الله خمینی (ره )  به عنوان حاکم شرع تعیین شد و پس از آن به ریاست دادگاه‌های انقلاب اسلامی رسید.
وی در یازدهمین شب ماه مبارک رمضان به دیار باقی شتافت